Eine andere Partition ist wie eine andere DB.
Über WRKRDBDIRE kannst du die andere DB eintragen und mittels CONNECT kannst du dann zu dieser in embedded SQL (auch STRSQL) verbinden und SQL's ausführen.
Per CRTSQLPKG musst du allerdings das interne SQL-Paket des Programmes auf die ZIEL-DB beamen.

Einen JOIN zwischen 2 DB's kannst du allerdings nicht erreichen.