Suche mal hier im Forum nach FTP und CLP.
Nur soviel:

Starte mal FTP mit F4 von der Kommandozeile.
Gib als System den Server an.
Melde dich dort an.
Gib den Befehl:

put /myifs/myverz/myfile

ein.
Die Datei wird übertragen.
Per "pwd" kannst du auch das Verzeichnis des Servers erfragen.

Mit "Quit" verläßt du FTP.

Die Befehle lassen sich auch in einer SRCPF ablegen.
Vor dem "FTP <MYSERVER>" machst du einen OVRDBF STDIN auf die SRCPF-Teildatei und einen OVRDBF STDOUT auf QPRINT.
Dann läuft der FTP auch im Batch.