Wenn du PASE installiert hast, steht mittels QSHELL der gcc-Compiler zur Verfügung, Linux ist da erst mal nicht erforderlich.
Allerdings wirst du damit keine AS/400-Linux-Distribution erstellen können sondern nur Anwendungen und Tools, die ohne Hardwarezugriffe funktionieren (Mail, PDFtoPCL, Ghostscript, u.ä.).