basierend auf deinen Ursprungsangaben habe ich das nun auch ausprobiert:

CPYTOIMPF FROMFILE(TESTCSV)
TOSTMF('/Home/Fuerchau/TestCSV')
MBROPT(*REPLACE)
STMFCODPAG(1252)
RCDDLM(*CRLF)
RMVBLANK(*BOTH)
FLDDLM(',')

Das Ergebnis ist folgendes:
"10.08.2009"";""11.09.2009"";15.10.2009","08:00:01"";""09:30:07"";""12.45.13"

Leerzeichen wurden korrekt entfernt, Das "-Zeichen wurde korrekt verdoppelt, siehe STRESCCHR(*STRDLM) !

Ich kann nun nur vermuten, dass deine Datenquelle keine Leerzeichen enthält !
Schau mal per DSPPFM -> F10 nach.