Generell ist das nicht möglich, da du das ja in jedem Programm selber erledigen musst.
Da du ja nicht jedem PC einzeln ein Keyboard-Mapping verpassen willst, ist das so nicht möglich.

Wenn du allerdings die 5250-Profile zentral auf einem Server verwaltest, kannst du ja dort auch eine gemeinsame AS400.KMP erstellen.

Da die WS-Profile Textdateien sind kannst du auch mit einem einfachen Progrämmchen alle Profile anpassen.
Wobei man da nicht ein bekanntes Zeichen ersetzen sondern per STRG und SHIFT+STRG die Zeichen einer Taste zuordnen sollte.