Ergänze dein Script mit folgenden Befehlen:

echo >stderr.txt;
touch -C 1252 stderr.txt;
java ..... 2>>stderr.txt;

Wichtig ist, dass die Datei vor der Befüllung die richtige CCSID haben muss.
Die einfache Umleitung "2>stderr.txt" erstellt immer eine neue Datei und löscht die Alte.
Die ergänzende Umleitung "2>>stderr.txt" hängt die Daten an, die CCSID wird berücksichtigt.