Mit WITH hast du viele vorteile. Angefangen von der Lesbarkeit bis hin die einzelnen Sub-Queries einfacher zu testen.
Es ist aber ähnlich wie bei einer View.
Wenn du das ganze SQL in eine View packst und dann ein Select * From View machst ändert sich auch nichts.
Einen Performance gewinn kannst du dann erhalten, wenn du es so aufsplittest wie ich es oben im Beispiel beschrieben habe.

Über das Forum ist es ab einer gewissen Stelle schwierig zu helfen.
In solchen Situationen biete ich bei meinen Kunden auch unterstützung via Telefon & TeamViewer an.

Im Visual Explain solltest du alles finden können, man muss halt nur wissen wo man suchen muss.
Es ist zugegeben anfangs nicht ganz einfach durchzublicken, aber es ist eines der wichtigstens Werkzeuge bei der Analyse