Dann hast du in den Daten keine 1:1-Beziehung sondern eine 1:N-Beziehung,
Jeder linke Satz wird mit allen Vorkommen der rechten Sätze über die Beziehung verknüpft.
Bei einer 1:N-Beziehung musst du eine 1:1-Beziehung erzwingen:

left join (select xydatum, sum(wert) from myfile group by xydatum) xy on Datum = xyDatum