Hat sich erledigt! Alles gut.

Für die Neugierigen, meine Lösung:
dcl-s xmlString sqltype(blob:1000000);
dcl-s base64String sqltype(clob:1500000);
exec sql
set :base64String = (
select base64_encode(T.DATA)
from table(QSYS2.IFS_READ_BINARY(:ifsFilePath)) as T(PATH, DATA)
);