Bist Du Dir sicher, dass es die Job-Wartezeit ist?
Ich würde ehrer sagen es ist die Datei-Wartezeit und/oder die Satz-Wartezeit.
Versuch' mal über OVRDBF die Datei-Wartezeit (WAITFILE) und/oder die Satz-Wartezeit (WAITRCD) für alle Tabellen in deinem QMQRY zu setzen.