Leider gibt es hierzu keine direkten Befehle. Der Weg ist etwas mühselig könnte aber folgendermaßen aussehen (SQL ist allerdings Voraussetzung):

Mittels DSPBOBJD alle *QRYDFN in eine Dateiliste ausgeben.
Für jeden Eintrag den Befehl RTVSQLSRC ausführen (dieser Befehl erstellt eine Quelle mit dem vollständige Select-Befehl).
Mittels Programm die Quellen dann analysieren und die Dateien aus der From-Klausel entnehmen.