Es gibt absolut keine Probleme damit.
Der RTVJOBA unterstützt beide Varianten, was das Abfragen der LIBL angeht.
Das Setzen der LIBL geht wiederum nur per QCMDEXC, falls es dynamisch erfolgt. Ansonsten unterstützt der Befehl selbst ja bis zu 250 Einträge.

ADDLIBLE/RMVLIBLE sind vollkommen unkritisch, da ja nur eine einzelne Lib angegeben wird.

Wie immer (jedefalls fast), sorgt auch hier IBM für Kompatibilität. Eine Umwandlung alter Programme ist nicht notwendig.